Комплементарные цепи днк антипараллельны (5’ концу в одной цепи соответствует 3’ конец другой цепи), синтез нуклеиновых кислот начинается с 5’, рибосома движется по ирнк от 5’ к 3’ концу. все виды рнк синтезируются на днк-матрице. в цепи рнк и днк могут присутствовать комплементарные участки – палиндромы, благодаря которым у молекулы может формироваться вторичная структура. фрагмент молекулы днк, на которой синтезируется участок центральной петли трнк, имеет следующую последовательность нуклеотидов (нижняя цепь - матричная): 5’ - аататтцгаггаататт - 3’ 3’ - ттатаагцтццттатаа - 5’ установите нуклеотидную последовательность участка трнк, который синтезируется на данном фрагменте. найдите на данном участке палиндром и установите вторичную структуру центральной петли трнк. определите аминокислоту, которую будет переносить эта трнк в процессе биосинтеза белка, если антикодон равномерно удалён от концов палиндрома. объясните последовательность решения задачи. при написании нуклеиновых кислот указывайте направление цепи

Для решения задачи воспользуемся принципами комплементарности, антипараллельности и правилами синтеза нуклеиновых кислот. 1. Синтез участка тРНК Транскрипция происходит на матричной цепи ДНК (нижняя цепь) в направлении от $3^{\prime }$ к $5^{\prime }$ концу. Синтезируемая РНК всегда строится от $5^{\prime }$ к $3^{\prime }$ концу, где аденину (А) соответствует урацил (У), тимину (Т) — аденин (А), гуанину (Г) — цитозин (Ц), а цитозину (Ц) — гуанин (Г).

• Матрица ДНК: 3’ - ТТАТААГЦТЦЦТТАТАА - 5’
• Последовательность тРНК: 5’ - ААУАУУЦГАНГААУАУУ - 3’

2. Поиск палиндрома и вторичной структуры Палиндром в нуклеиновых кислотах — это самокомплементарный участок, который позволяет молекуле «склеиться» сама с собой, образуя шпильку (вторичную структуру).

1. Проанализируем последовательность тРНК: 5’ - ААУАУУЦ - ГАГ - ГААУАУУ - 3’.
2. Края последовательности комплементарны друг другу:
   • Начало: 5’ - ААУАУУЦ ...
   • Конец: ... ГААУАУУ - 3’ (если читать с конца в обратном направлении: УУАУААГ).
3. Палиндром: это участки ААУАУУЦ и ГААУАУУ.
4. Вторичная структура: участки палиндрома образуют «стебель» (связываются водородными связями), а нуклеотиды между ними (ГАГ) образуют петлю.

Схема вторичной структуры:

 Г - А / Г А - У | А - У | У - А | (петля) А - У | У - А | У - А | Ц - Г / 5' 3' 

3. Определение антикодона и аминокислоты По условию антикодон равномерно удален от концов палиндрома. Это значит, что он находится в самой середине последовательности, то есть в центральной петле.

1. Последовательность тРНК: ААУАУУЦ - ГАГ - ГААУАУУ.
2. Центральный триплет (петля) — это ГАГ.
3. В тРНК антикодон записывается в направлении от $5^{\prime }$ к $3^{\prime }$. Таким образом, антикодон — 5’-ГАГ-3’. Для определения аминокислоты по таблице генетического кода необходимо найти соответствующий кодон иРНК. Кодон комплементарен и антипараллелен антикодону.
   • Антикодон тРНК: 5’ - ГАГ - 3’
   • Кодон иРНК: 3’ - ЦУЦ - 5’
   Перевернем кодон для чтения по таблице (от $5^{\prime }$ к $3^{\prime }$): 5’-ЦУЦ-3’. По таблице генетического кода кодону ЦУЦ соответствует аминокислота ЛЕЙ (лейцин).

Резюме и последовательность решения

1. По принципу комплементарности и антипараллельности на основе нижней цепи ДНК построена последовательность тРНК: 5’-ААУАУУЦГАГГААУАУУ-3’.
2. Выделены комплементарные участки на концах фрагмента (палиндромы), которые при сближении формируют шпильку (стебель и петлю).
3. На основании условия о равном удалении определен антикодон, находящийся в петле: 5’-ГАГ-3’.
4. По антикодону тРНК определен кодон иРНК: 5’-ЦУЦ-3’.
5. С помощью таблицы генетического кода по кодону иРНК определена транспортируемая аминокислота — Лейцин.

Хотите, чтобы я разобрал подобную задачу, где требуется определить последовательность ДНК по известной аминокислоте?