В слове ель корень ел или ель?

В слове ель корнем является вся основа целиком — ель. Подробный разбор состава слова:

• ель — корень.
• нулевое окончание — выявляется при изменении формы слова: ел-и, ел-ью, ел-ями.
• ель — основа слова.

Почему мягкий знак входит в корень? Мягкий знак в данном случае не является отдельной морфемой (например, суффиксом). Он служит для обозначения мягкости согласного звука [л’] на письме. Поскольку корень — это главная значимая часть слова, в которой заключено его лексическое значение, и звук [л’] является частью этого значения, буква «ь» графически завершает корень. Нюансы с однокоренными словами: В некоторых родственных словах может происходить чередование е/ё или ль/л:

• Ёлк-а — корень ёл-, где «ь» отсутствует из-за последующего твердого суффикса «к».
• Ель-ник — корень ель-, мягкость сохраняется перед суффиксом.
• Ел-овый — корень ел-, мягкость пропадает перед гласным «о».

Согласно «Морфемно-орфографическому словарю» А. Н. Тихонова, в начальной форме слова «ель» корнем признается именно -ель-. Хотите разобрать по составу другие похожие слова, например, «тень» или «день»?