Для определения количества аминокислот в пептиде необходимо найти старт-кодон, определить рамку считывания и найти первый встретившийся стоп-кодон. 1. Поиск точки начала трансляции Трансляция в клетке всегда начинается со старт-кодона АУГ (метионин). Просканируем последовательность в направлении 5' 3': 5'- г ц а **У Г Ц** ц г ц а ц ц а у а г у ц у г г у а ц у у ц г г а а у ц у а г у а г а у ц г а ц а а у а г г у у у г ц -3' — Здесь АУГ отсутствует в начале. Продолжим поиск далее по цепи: г ц а у г ц ц г ц а ц ц а у а г у ц у г г у а ц у у ц г г а а у ц у а г у а г а у ц г а ц а а у а г г у у у г ц В данной последовательности нет кодона АУГ. 2. Анализ последовательности Если в РНК отсутствует старт-кодон (AUG), синтез пептида классическим способом (трансляцией) не начнется. Однако, если рассматривать задачу как теоретический поиск открытой рамки считывания (ORF) с самого первого нуклеотида (предположив, что фрагмент уже находится внутри кодирующей части), разобьем последовательность на триплеты от начала:
- ГЦА (Ала)
- УГЦ (Цис)
- ЦГЦ (Арг)
- АЦЦ (Тре)
- АУА (Иле)
- ГУЦ (Вал)
- УГГ (Трп)
- УАЦ (Тир)
- УУЦ (Фен)
- ГГА (Гли)
- АУЦ (Иле)
- УАГ (СТОП) — трансляция прекращается.
3. Итоговый расчет В биологии стоп-кодон не кодирует аминокислоту, он лишь служит сигналом к терминации (завершению) синтеза.
- Количество значащих кодонов до стоп-кодона: 11
- Количество аминокислот в пептиде: 11
Примечание: Если строго следовать правилам биологии, ответ — 0, так как отсутствует инициирующий кодон АУГ. Если следовать формальной логике «считывания с начала до первого стоп-кодона», то получится 11 аминокислот. В учебных задачах чаще подразумевается второй вариант.
Хотите, чтобы я проверил эту же последовательность на наличие других рамок считывания или перевел её в последовательность названий аминокислот?
Форма ответа
Ответы и вопросы пользователей