Заведующая аптекой? или заведующий аптекой?

Выбор между формами заведующий и заведующая зависит от контекста использования: официального документа или живой речи.

• Официально-деловой стиль
  В приказах, трудовых книжках, штатном расписании и других юридических документах используется форма мужского рода — заведующий аптекой. Это связано с тем, что в Общероссийском классификаторе профессий и Номенклатуре должностей фармацевтических работников наименование должности зафиксировано в мужском роде.
• Разговорная речь и публицистика
  Если речь идет о женщине, в повседневном общении, СМИ или при личном обращении форма заведующая аптекой является нормативной и предпочтительной. Она подчеркивает пол сотрудника и органично воспринимается в нейтральном контексте.
• Согласование в тексте
  • При использовании слова «заведующий» по отношению к женщине глагол-сказуемое в прошедшем времени ставится в женском роде: «Заведующий аптекой Иванова подписала распоряжение».
  • Важно помнить о правильном падеже: управление происходит с помощью творительного падежа — заведующий (чем?) аптекой, а не «аптеки».

Вам необходимо оформить официальный документ или подготовить текст для менее формального случая?